สถาบันวิจัยเกษตรกรรมแห่งชาติของฝรั่งเศส ย้ายมาใช้ Windows HPC Server 2008

สถาบันวิจัยเกษตรกรรมแห่งชาติของฝรั่งเศส (French National Institute for Agricultural Research - INRA) ประสบความสำเร็จในการย้ายระบบประมวลผล DNA ของแบคทีเรียจากยูนิกซ์มาเป็น Windows HPC 2008 ซึ่งประหยัดเวลาในการพัฒนาได้ถึง 1 ปี

สถาบันวิจัยเกษตรกรรมแห่งชาติของฝรั่งเศส (French National Institute for Agricultural Research - INRA) เป็นสถาบันวิจัยด้านเกษตรชั้นนำแห่งหนึ่งของยุโรป มีนักวิจัยกว่า 150 คนและมีห้องปฏิบัติการวิจัยอยู่ทั่วประเทศฝรั่งเศส INRA ทำหน้าที่ศึกษาการเพาะพันธุ์พืชที่มีคุณค่าทางอาหาร ด้านการอนุรักษ์สิ่งแวดล้อม และการเพาะปลูกอย่างยั่งยืน

โครงการ Metagenomics of the Human Intestinal Tract (MetaHIT) ของสถาบันเป็นโครงการศึกษาพันธุกรรมของแบคทีเรียชนิดหนึ่งที่อาศัยอยู่ในลำไส้ของสัตว์ (รวมถึงลำไส้ของมนุษย์ด้วย) โดยศึกษาว่าแบคทีเรียชนิดนี้มีผลต่อโรคอ้วนและโรคทางลำไส้อย่างไรบ้าง

MetaHIT Logo

โครงการนี้จำเป็นต้องใช้คอมพิวเตอร์สมรรถนะสูงในการวิเคราะห์ DNA ของแบคทีเรีย แต่ฝ่ายไอทีของสถาบันมีพนักงานเพียง 5 คนเท่านั้น เดิมทีพนักงานทีมนี้มีประสบการณ์ทำงานบนลินุกซ์และ Solaris แต่เนื่องจากโครงการนี้ใหญ่มาก ต้องร่วมมือกับห้องทดลองหลายแห่งรวมถึงห้องทดลองที่อยู่นอกประเทศฝรั่งเศสด้วย หัวหน้าฝ่ายไอทีของสถาบันมองว่านี่เป็นโครงการระดับนานาชาติที่ต้องบริหารจัดการทรัพยากรข้ามห้องทดลองเป็นอย่างดี ทีมไอทีจึงถูกบังคับกลายๆ ให้สร้างเทคโนโลยีที่ช่วยให้นักวิจัยเข้าถึงข้อมูลได้ง่ายขึ้น ซึ่งทางออกของสถาบันก็คือระบบการประมวลผลแบบกระจายที่ใช้คอมพิวเตอร์สมรรถนะสูง (HPC) ช่วยประมวลผลนั่นเอง

สุดท้ายแล้วห้องทดลองหลักของโครงการตัดสินใจย้ายมาใช้ Windows HPC Server 2008 ซึ่งทำงานบนคลัสเตอร์แบบเบลด Dell PowerEdge M600 ซึ่งเซิร์ฟเวอร์แต่ละชุดมีเบลด 8 ตัว และ PowerEdge 2950 หนึ่งตัวเป็นเครื่องแม่ ส่วนระดับแอพพลิเคชันนั้นเป็นระบบกริดที่ใช้สถาปัตยกรรมแบบ SOA (service-oriented architecture) ซึ่งช่วยแก้ปัญหาการกระจายทรัพยากรในการประมวลผลระหว่างห้องทดลองแต่ละแห่ง การที่ซอฟต์แวร์ทำงานบนกริดนั้นทำให้เหมาะกับระบบปฏิบัติการ Windows HPC 2008 ขั้นตอนการทำงานคือนักวิจัยจะสร้างอัลกอริธึมในการคำนวณบน Excel จากนั้นจึงส่งไปคำนวณบนคอมพิวเตอร์ระบบกริดอีกต่อหนึ่ง ส่วนเครื่องมือที่ใช้พัฒนาซอฟต์แวร์ของสถาบันนั้นเป็น Visual Studio 2008 เพื่อย้ายระบบเดิมที่เป็นซอฟต์แวร์ปิดบนลินุกซ์มาทำงานบนวินโดวส์

การที่ย้ายมาใช้ระบบของไมโครซอฟท์ทั้งหมดทำให้การทำงานที่ต้องใช้ Microsoft Office และ Visual Studio ทำงานกับกริดคอมพิวเตอร์ที่เป็น Windows HPC ได้ดีขึ้น ทีมไอทีของสถาบันมองว่าการย้ายระบบคอมพิวเตอร์ครั้งนี้ทำได้เร็วกว่าที่คาดถึง 1 ปีเต็ม ผลดีอื่นๆ คือนักวิจัยสามารถคัดลอกข้อมูลข้ามกับจาก Word ไปยัง Excel ได้สะดวกมากขึ้น นอกจากนี้ทีมไอทีเองก็ยังสะดวกในการดูแลระบบคลัสเตอร์มากขึ้น เนื่องจากอินเทอร์เฟซของ Windows HPC Server 2008 มีเครื่องอำนวยความสะดวกให้มากมาย เช่น Administration Console เป็นต้น

ที่มา - เอกสาร Whitepaper ของไมโครซอฟท์